68分Nature子刊：二代类器官技术助力肠道免疫研究 | 热心肠日报
今天是第2435期日报。
Nature子刊：研究胃肠道免疫的类器官新工具
Nature Biotechnology[IF:68.164]
① 将来源于多能干细胞的人类肠道类器官（HIOs）移植到具有人源化免疫系统的小鼠的肾囊中，人的免疫细胞可以迁移到HIOs的黏膜层，12周时，可在固有层和上皮中形成类似于人肠道淋巴滤泡的细胞聚集；② 移植的HIOs中的淋巴样结构具有肠道相关免疫组织的特征，在时空发育上与人类胎儿肠道中淋巴滤泡发育相似；③ 微生物（大肠杆菌裂解液）暴露后，移植的HIOs中上皮微皱褶细胞（M细胞）增加并转运腔内抗原以激活免疫细胞，使HIOs内IgA水平增加。
In vivo development of immune tissue in human intestinal organoids transplanted into humanized mice
01-26, doi: 10.1038/s41587-022-01558-x
【主编评语】免疫系统以及免疫-上皮互作在胃肠道稳态维持、抵御病原体、免疫耐受等过程中发挥着重要作用。实验小鼠模型被广泛用于肠道免疫的研究，但与人之间还存在实质性差异。而人类肠道类器官（HIOs）通常也无法充分反应免疫系统的复杂性。美国辛辛那提儿童医院医学中心研究人员近日在Nature Biotechnology发表文章，报道了具有功能性人体免疫组织的下一代HIOs体内模型，通过将HIOs移植到具有人源化免疫系统的小鼠中，获得了具有发育中人类肠道免疫景观和响应微生物暴露功能的组织，或可应用于免疫-上皮互作以及过敏、感染性肠道疾病等研究。（@芥末）
Cell子刊：单细胞转录组详解克罗恩病的免疫失调
Immunity[IF:43.474]
① 分析71位不同炎症状态的克罗恩病（CD）患者回肠末端和结肠的72万多个细胞，发现器官和区室对急性和慢性炎症有特定反应；② 免疫的变化主要在细胞组成，而上皮细胞和基质细胞中转录变化占主导；③ 炎症条件下，大肠和小肠具有不同的转录反应，尤其是IBD风险基因的表达；④ 粘蛋白和封闭蛋白的表达变化重构屏障功能，肠道内分泌细胞代谢变化；⑤ CHMP1A、TBX3和RNF168是肌成纤维细胞中胶原蛋白表达的调节因子，或调控CD纤维化并发症。
The landscape of immune dysregulation in Crohn’s disease revealed through single-cell transcriptomic profiling in the ileum and colon
01-30, doi: 10.1016/j.immuni.2023.01.002
【主编评语】克罗恩病（CD）是一种慢性胃肠道疾病，在全球范围内发病率不断上升。CD的病理机制是多因素的，涉及遗传、免疫和环境因素的复杂相互作用，了解其病因需要进行系统性的研究。Immunity近期发表的文章，通过对CD病人的回肠和结肠进行单细胞转录组测序，定义了CD的上皮细胞、基质细胞和免疫细胞的特性，并揭示出疾病相关的成纤维细胞中胶原生成的新的调节因子。（@章台柳）
Science子刊：非T细胞依赖反应，可调动针对肠道细菌抗原的边缘区B细胞分化
Science Immunology[IF:30.63]
① 纳入6名志愿者，接种Pneumovax疫苗，确定参与非T细胞依赖（TI）反应的细胞类群；② 对接种疫苗7天后分离出的浆细胞（PC），以及接种前后不同的B细胞亚群进行高通量测序，发现PC反应促进了克隆的扩增表达，主要是IgM克隆；③ 从PC克隆中提取的重组单克隆抗体，可识别肠道菌群中的多种细菌，表明人的TI反应主要是调动边缘区和转换的B细胞；④ B细胞或在针对细菌抗原的粘膜免疫反应中进行了预分化，并通过突变获得了肺炎球菌的交叉反应性。
T-independent responses to polysaccharides in humans mobilize marginal zone B cells prediversified against gut bacterial antigens
01-27, doi: 10.1126/sciimmunol.ade1413
【主编评语】边缘区（MZ）B细胞是小鼠中非T细胞依赖（TI）反应的主要参与者之一。Science Immunology发表的研究成果，为了确定负责在免疫反应中产生抗肺炎球菌capPS IgM、IgG和IgA的B细胞亚群，用Pneumovax（一种TI疫苗模型）为健康人接种疫苗。肺炎球菌疫苗产生了大量的浆细胞（PC）反应，系统地动员了预先多样化和预先扩增的克隆，其中主要包括IgM。肺炎球菌特异性克隆显示出对肠道菌群中多种细菌的识别，表明人类的TI反应主要是调动MZ和转换的B细胞。（@NL）
Science子刊：DDX5抑制Treg，促进小鼠肠道炎症
Science Advances[IF:14.957]
① 在RORγt+ Treg中，HIF1α是调控IL-10表达的主要转录因子；② RNA结合蛋白——DDX5可作为转录抑制辅因子，抑制RORγt+ Treg的HIF1α表达，从而抑制其下游的IL-10表达；③ 机制上，DDX5可促进HIF1α基因位点的R环解聚，并抑制RNA Pol2向HIF1α基因位点的招募；④ T细胞特异性敲除DDX5（DDX5ΔT）小鼠的RORγt+ Treg的抑制功能得到增强，并可在肠道炎症中起到更好的保护性作用；⑤ 敲除或抑制HIF1α可恢复DDX5ΔT小鼠对肠道炎症的易感性。
RNA binding protein DDX5 restricts RORγt+ Treg suppressor function to promote intestine inflammation
02-01, doi: 10.1126/sciadv.add6165
【主编评语】RORγt+ 调节性T细胞（Treg）在抑制T细胞过度活化及维持组织稳态中发挥重要作用。Science Advances上发表的一项最新研究结果，发现RNA结合蛋白——DDX5可通过抑制HIF1α的表达，以抑制RORγt+ Treg的IL-10表达，从而促进小鼠的肠道炎症。（@aluba）
Science子刊：如何防治过敏？（综述）
Science Translational Medicine[IF:19.319]
① 上皮屏障、免疫系统、气候变化和污染物都可导致过敏；② 预防方式有：在幼时接触过敏原、避免花粉和其他空气污染物、保湿剂修复皮肤屏障、幼时丰富饮食多样性等；③ 治疗方法有：抗组胺药、皮质类固醇、白三烯受体拮抗剂、短效β-受体激动剂、生物制剂、Janus激酶抑制剂、过敏原特异性免疫疗法等；④ 应建立全面的诊断，确定病人的特定过敏原并排除虚假过敏原；⑤ 监测疗程的效用和持续时间，改进准确诊断和治疗的选项，提供有效策略预防过敏。
Allergy: Mechanistic insights into new methods of prevention and therapy
01-18, doi: 10.1126/scitranslmed.add2563
【主编评语】过敏在生活中普遍存在。Science Translational Medicine近期发表综述，围绕过敏的流行病学和病理学因素展开探讨，包括肠屏障、免疫系统、气候改变和污染物的作用等，并总结了相关预防和治疗过敏的方法和措施，值得相关人士阅读。（@Bingbing）
FPIES患儿的生命早期肠道菌群失调
Allergy: European Journal of Allergy and Clinical Immunology[IF:14.71]
① 纳入874名新生儿，随访3年期间共确诊8例FPIES，最常见的驱动因素包括燕麦、大米及牛奶；② 相比于健康儿童，FPIES患儿更有可能有食物过敏家族史（50% vs. 15.9%）；③ FPIES的平均疾病表现年龄为6月龄，出生后6个月期间，FPIES患儿的粪便菌群失调；④ 表现为：青春双歧杆菌显著减少，拟杆菌属（尤其是脆弱拟杆菌）、Holdemania、Lachnobacterium、鲁氏不动杆菌等致病共生菌增加，双歧杆菌利用寡糖产生短链脂肪酸的代谢通路显著减少。
Early infancy dysbiosis in food protein-induced enterocolitis syndrome: a prospective cohort study
01-12, doi: 10.1111/all.15644
【主编评语】Allergy: European Journal of Allergy and Clinical Immunology上发表的一项前瞻性队列研究结果，在874名新生儿中，3年随访期间的食物蛋白诱导性小肠结肠炎综合征（FPIES）累计发病率为0.92%；而在FPIES患儿出生后的6个月期间，可观察到肠道菌群失调及短链脂肪酸代谢通路减少。（@aluba）
Cell 子刊：新生儿中菌群依赖及其非依赖的唾液免疫发育机制
Cell Reports[IF:9.995]
① 高水平的中性粒细胞及新生儿Fc受体（FcRn）转移的母体IgG以不依赖菌群的方式暂存于新生儿小鼠的唾液腺中；② 断奶期间唾液腺中的中性粒细胞、FcRn和IgG减少，而pIgR以依赖生长停滞特异性6（GAS6）的方式上调，且与菌群无关；③ 唾液IgA在断奶后开始产生，并依赖CD4辅助、IL-17及菌群。④ 新生儿在断奶阶段一旦受到微生物微生物感染，其树突状细胞从口腔粘膜迁移到唾液腺，并激活T细胞，表明唾液腺是免疫诱导部位。
Microbiota-dependent and -independent postnatal development of salivary immunity
01-07, doi: 10.1016/j.celrep.2022.111981
【主编评语】唾液可调节菌群与口腔免疫系统之间的互作，但新生儿如何建立唾液免疫的机制尚不清楚。近日，发表在Cell Reports上的这篇文章，研究了新生儿唾液腺中产生的诱导免疫机制，并揭示唾液腺是免疫诱导部位。（@圆圈儿）
急性阑尾炎或表现两种不同的微生物组特征
Gut Microbes[IF:9.434]
① 纳入60名患有急性阑尾炎（AA）的儿童和青少年，分析其阑尾、直肠和腹膜样本的微生物组，评估细菌、古细菌和真菌的组成和潜在功能；② 阑尾微生物组分析表明，根据AA的严重程度会分为复杂和不复杂两个疾病特征，表现为两种不同的微生物群落结构；③ 复杂阑尾炎与口腔细菌病原体在阑尾的显著局部扩张有关，其中受梭菌属、卟啉单胞菌属和微单胞菌属的影响最大；④ 非复杂性阑尾炎的特点是与肠道相关的微生物组。
Acute appendicitis manifests as two microbiome state types with oral pathogens influencing severity
01-23, doi: 10.1080/19490976.2022.2145845
【主编评语】越来越多的证据表明，急性阑尾炎（AA）不是一种疾病，而是两种疾病：复杂的阑尾炎，它与导致穿孔或阑尾周围脓肿的坏死有关；非复杂的阑尾炎，它不一定导致穿孔。Gut Microbes发表的研究，前瞻性地招募了60名AA患者，根据术后病理结果对他们进行分组，并分析阑尾以及腹膜和直肠（拭子）中的微生物组成。结果发现无并发症的AA的特点是典型的胃肠道微生物的相对丰度增加，而有并发症的AA则与易位的口腔微生物有关。本研究提示，AA存在两种疾病类型，先进的微生物组诊断可以改善无并发症的AA的非手术治疗。（@NL）
免疫磁性捕获普拉梭菌，可选择性地改变粪便菌群及其免疫调节特性
Microbiology spectrum[IF:9.043]
① 利用普拉梭菌M21特异性的多克隆抗体，联合免疫分离技术从合成菌群以及人类粪便菌群中捕获普拉梭菌；② 利用外周血单核细胞（PBMC）模型，发现通过上述免疫分离技术捕获的具有不同相对丰度的普拉梭菌对健康供体菌群具有免疫调节水平；③ 富集普氏梭菌菌群或纯培养物预孵育可显著降低克罗恩病菌群引起的促炎细胞因子白细胞介素1β 、γ干扰素和肿瘤坏死因子α水平。
Immunomagnetic Capture of Faecalibacterium prausnitzii Selectively Modifies the Fecal Microbiota and Its Immunomodulatory Profile
01-04, doi: 10.1128/spectrum.01817-22
【主编评语】普拉梭菌是健康人肠道菌群中最丰富的细菌菌群之一，其丰度的减少与多种人类疾病如克罗恩病有关。近日，发表在Microbiology spectrum上的这篇文章，利用免疫技术联合流式分离技术，战略性地改变特定肠道菌群的相对丰度，深入探究菌群与宿主的相互作用，从而有助于研究菌群的贡献。（@圆圈儿）
乙酸通过STING促进小肠IgA产生
Inflammatory Bowel Diseases[IF:7.29]
① 与WT小鼠相比，Sting-/-小鼠的粪便和血清中lgA水平较低；② 干扰素基因刺激物（STING）激动剂不直接作用于B细胞或树突状细胞以诱导IgA产生；③ Sting-/-小鼠肠道菌群组成改变，产生SCFA的肠道细菌减少，SCFA发酵途径下调；④ STING可能通过其下游产物1型干扰素调节肠道IgA和乙酸生成细菌，并且通过肠道细菌产生的乙酸盐以GPR43依赖的方式促进肠道IgA；⑤ 在Sting-/-小鼠中，主要短链脂肪酸乙酸减少，补充乙酸可以恢复小鼠肠道IgA的产生。
STING Promotes Intestinal IgA Production by Regulating Acetate-producing Bacteria to Maintain Host-microbiota Mutualism
01-20, doi: 10.1093/ibd/izac268
【主编评语】小肠免疫因子IgA在维持肠道稳态以及宿主-微生物群稳态方面具有关键作用。一些肠道菌分泌循环双核苷酸在肠腔，进而激发cGAS-STING通路。本文主要探究STING是如何调控小肠IgA。研究结果显示，STING可能通过其下游产物1型干扰素调节肠道IgA和乙酸生成细菌，并且通过肠道细菌产生的乙酸盐以GPR43依赖的方式促进肠道IgA。（@Bingbing）
感谢本期日报的创作者：阿当，NL，aluba，Sunflower，圆圈儿
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