模拟禁食可抗癌？全球首个随机对照试验结果公布 | 热心肠日报
今天是第1500期日报。
Nature子刊：模拟禁食饮食辅助乳腺癌化疗，效果不俗
Nature Communications[IF:11.878]
① 纳入131名HER2阴性的二/三期乳腺癌患者，随机分为2组，在每个化疗周期前和治疗当天的4天内进行模拟禁食饮食（FMD）或常规饮食；② FMD组没有使用减轻化疗不良反应的地塞米松，但两组在治疗毒性方面无显著差异；③ FMD可显著增强患者的治疗应答，与对照组相比，FMD组有更多的患者达到影像学（MRI或超声）的完全或部分缓解，以及癌细胞减少超过90%的病理应答，且依从性越高疗效越好；④ FMD还减轻了化疗诱导的T细胞DNA损伤。
Fasting mimicking diet as an adjunct to neoadjuvant chemotherapy for breast cancer in the multicentre randomized phase 2 DIRECT trial
06-23, doi: 10.1038/s41467-020-16138-3
【主编评语】动物研究显示，短期的禁食或模拟禁食饮食（FMD）有助于改善癌症化疗的毒副作用，同时增强治疗的疗效。《Nature Communications》最新发表了首个评估FMD用于辅助癌症化疗的安全性和有效性的随机对照试验，表明FMD可有效增强化疗疗效，在减轻化疗毒副作用方面也有一定效果。禁食和FMD用于癌症治疗，值得进一步开展临床研究。（@mildbreeze）
Cell子刊：你的胆固醇水平或由肠道细菌来决定
Cell Host and Microbe[IF:15.753]
① 对宏基因组、代谢组、分离基因组和酶功能的综合分析，鉴定出在人类肠道微生物组中参与胆固醇代谢的候选细菌基因ismA，编码有助于粪醇形成的微生物胆固醇脱氢酶；② ismA存在于一个未培养的细菌分支中，属于梭菌类群IV，且普遍存在于不同地理分布的人群中；③ IsmA编码细菌的存在与人体的粪便胆固醇降低、粪便胆石酮和粪醇水平升高有关；④ 含有形成粪醇细菌的个体，其血清总胆固醇水平显著降低，效果与脂质稳态基因的变化相当。
Cholesterol Metabolism by Uncultured Human Gut Bacteria Influences Host Cholesterol Level
06-15, doi: 10.1016/j.chom.2020.05.013
【主编评语】人类肠道微生物具有强大的代谢能力，但肠道微生物与人类代谢之间互作的机制仍不清楚。《Cell Host and Microbe》近期发表文章，鉴定出肠道细菌的胆固醇脱氢酶，并揭示出胆固醇代谢细菌的出现与宿主的粪便、血清总胆固醇降低相关，可直接影响人类健康。（@爱的抉择）
生命早期菌群促进免疫发育的新机制
Gut[IF:17.943]
① 母鼠妊娠晚期施用抗生素，证实菌群的减少会推迟乳鼠早期脾脏中常规树突细胞1（cDC1）的分化；② 早期微生物暴露会刺激新生乳鼠脾脏单核细胞和巨噬细胞在生命头3天产生TNF；③ 髓系来源的TNF信号作用于乳鼠cDC1前体细胞（pre-cDC1）的C1q和β-catenin通路，调控脂肪酸代谢，对限制新生期耐受性环境和调节性pre-cDC1的成熟非常重要；④ 李斯特菌感染乳鼠，肠道菌群诱导TNF产生，TNF通过调节IL-10和 IL-12p40，诱导保护性CD8+ T细胞响应。
Very early-life exposure to microbiota-induced TNF drives the maturation of neonatal pre-cDC1
06-16, doi: 10.1136/gutjnl-2019-319700
【主编评语】在抗炎和耐受免疫为主的新生儿期，诱导对病原体的免疫保护尤为重要。《Gut》近期发表的文章显示，生命早期菌群能刺激新生乳鼠的髓系细胞产生促炎细胞因子TNF，TNF促进调节性pre-cDC1的成熟。此外，在李斯特菌感染模型中，肠道菌群诱导的TNF促进保护性CD8+ T细胞反应，清除病原体。（@爱的抉择）
中山大学：人类肠道宏基因组数据库gutMEGA
Briefings in Bioinformatics[IF:9.101]
① 人肠道宏基因组图谱（gutMEGA）是一个注释良好的综合数据库，共保存了人类182项已发表研究的定量肠道菌群数据集；② 通过整理表型，肠道菌群组成及实验信息（样本来源，测序方法，处理软件等），gutMEGA整合了在776个条件中，7个分类水平下(界、门、纲、目、科、属、种)共6457个分类单元的59123个定量信息；③ gutMEGA网站还具有多种浏览和搜索功能，可为用户提供一种快速简便的获取各表型间肠道菌群相对丰度的方法。
gutMEGA: a database of the human gut MEtaGenome Atlas
06-04, doi: 10.1093/bib/bbaa082
【主编评语】为了方便科学家查询和检索已发布的肠道菌群宏基因组测序数据，在这项研究中，中山大学第一附属医院的Xiaoxing Li和中山大学附属肿瘤医院的Ze-Xian Liu与团队，开发了肠道宏基因组图谱（gutMEGA），这是一个注释齐全的综合数据库，用于管理和托管来自人类已发表的肠道菌群定量数据集。通过仔细整理肠道菌群的组成，表型和实验信息，gutMEGA最终在776个条件下整合了7种不同水平（界，门，纲，目，科，属和种）的6457类群的59132个定量信息。此外，通过各种浏览和搜索功能，gutMEGA为用户提供了一种快速简便的方法来获取表型之间肠道微生物的相对丰度。总体而言，gutMEGA是用于肠道宏基因组研究的便捷而全面的资源，可以从 http://gutmega.omicsbio.info 免费访问。（@刘永鑫-中科院-宏基因组）
国内团队：菌群诱导IL-17的产生以抑制念珠菌感染
Critical Care[IF:6.959]
① 在侵入性念珠菌感染的小鼠模型中，抗生素处理可降低小鼠的肠道菌群多样性，并显著改变整体肠道菌群结构，同时降低了小鼠的生存率；② 抗生素处理可抑制宿主的对真菌入侵的清除作用，并增加血清IL-6、TNF-α及IL-10的水平，降低IL-17A、IL-22、IL-12及IFN-γ的水平，促进巨噬细胞与中性粒细胞在肾组织中的浸润，以恶化炎症应答；③ IL-17A处理或粪菌移植均可缓解抗生素处理后小鼠的念珠菌感染症状。
Microbiota-driven interleukin-17 production provides immune protection against invasive candidiasis
05-27, doi: 10.1186/s13054-020-02977-5
【主编评语】肠道菌群可通过调控免疫应答以影响宿主对感染性疾病的易感性。重庆医科大学附属第一医院的曹炬团队与广州市第一人民医院的徐邦牢团队在《Critical Care》上发表的一项最新研究，在念珠菌感染小鼠模型中发现，抗生素处理可改变肠道菌群结构及多样性，抑制宿主对真菌感染的防御机制，降低IL-17A、IFN-γ等细胞因子的水平并增强炎症应答，从而降低小鼠的生存率。进一步研究发现，IL-17A处理或粪菌移植可在念珠菌感染中起到保护作用。（@szx）
Nature子刊：肠道特征菌可用于海绵状血管瘤（CA）的诊断和分型
Nature Communications[IF:11.878]
① 宏基因组鸟枪测序进一步证实CA患者与非CA人群肠道微生物群具有显著差异；② CA患者革兰氏阴性菌显著增多，革兰氏阳性菌柔嫩梭菌和青春双岐杆菌显著减少；③ CA患者肠道菌富集革兰氏阴性菌LPS生物合成、维生素B6合成以及尿素循环相关基因；④ 根据肠道特征菌群变化，可以区分侵袭性和非侵袭性CA，有出血史和无出血史CA；⑤ CA及各亚类患者中，肠道特征菌群和血浆炎症指标具有一定相关性，联合运用可以对提高CA患者的诊断和分型
Permissive microbiome characterizes human subjects with a neurovascular disease cavernous angioma
05-27, doi: 10.1038/s41467-020-16436-w
【主编评语】海绵状血管瘤(CA)是常见的血管异常导致脑出血的疾病，16S宏基因分析显示，非CA和CA个体肠道微生物组差异。近期一篇发表在《Nature Communications》的文章通过宏基因组鸟枪测序法详细分析了CA个体以及不同亚型的CA个体的肠道菌群差异和特征菌群变化。研究结果提示微生物组变化联合临床血浆炎症生物标志物的加权组合可以增强对疾病严重情况的评价。（@Zhonghua）
短期过量进食对肥胖者的菌群及肝脏脂肪的影响
Clinical Nutrition[IF:6.402]
① 38名超重/肥胖成年人随机分为3组，每日分别摄入来自饱和脂肪、不饱和脂肪或单糖的额外1000卡热量，干预持续3周；② 在过量进食干预前后，菌群的整体群落结构维持稳定，菌群功能未发生显著变化；③ 个别分类群的丰度发生了饮食特异性变化：饱和脂肪增加变形菌门、不饱和脂肪增加丁酸盐产生菌、单糖增加乳球菌属与大肠杆菌；④ 干预前的脱硫弧菌科（尤其是嗜胆菌属）的丰度与过量进食诱导的肝脏脂肪增加相关，且与干预组别无关。
Impact of short-term overfeeding of saturated or unsaturated fat or sugars on the gut microbiota in relation to liver fat in obese and overweight adults
05-16, doi: 10.1016/j.clnu.2020.05.008
【主编评语】肠道菌群与非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）的发病机制相关。《Clinical Nutrition》上发表的一项RCT结果，对38名超重/肥胖成年人（其中包括12名NAFLD患者）进行了3周的饮食干预，受试者在干预期间过量进食，通过3种不同干预方式每日摄入额外的1000卡热量。结果发现，短期的过量进食并未在群落水平改变肠道菌群，但不同干预方式对特定分类群有特异性影响。同时，并未鉴定出与脂肪肝相关的菌群特征，但发现干预前的嗜胆菌属丰度与饮食诱导的肝脏脂肪增加相关。（@szx）
丙酸缓解高脂饮食诱导的小鼠肥胖及NASH，并改善脑血管功能
FASEB Journal[IF:5.391]
① Ldlr-/-.Leiden小鼠喂食16周HFD以诱导肥胖，随后12周在喂食HFD的同时，分别喂食丙酸、己酸及对照；② 丙酸可降低体重、收缩压和空腹胰岛素水平，并抑制HFD引起的肝脏大泡性脂肪变性、肝细胞肥大、肝脏炎症和胶原含量；③ 丙酸可增加1型葡萄糖转运蛋白阳性的脑血管数量，恢复脑血管活性、视神经束微结构灰白质完整性，以及HFD对体感与视觉皮层的影响；④ 然而，丙酸可增加类似焦虑的行为，并降低海马中的突触形成及谷氨酸信号，应谨慎使用。
Propionic acid and not caproic acid, attenuates nonalcoholic steatohepatitis and improves (cerebro) vascular functions in obese Ldlr−/−.Leiden mice
05-30, doi: 10.1096/fj.202000455R
【主编评语】《FASEB Journal》上发表的一项最新研究，发现在缺失LDL受体的非酒精性脂肪性肝炎（NASH）小鼠模型中，喂食丙酸可缓解高脂饮食诱导的小鼠肥胖、脂肪肝、肝脏炎症，降低小鼠的收缩压及空腹胰岛素水平，并改善脑血管功能，但同时可促进焦虑，并抑制海马中的突触形成。（@szx）
中科院：轮胎颗粒导致土壤生态系统失调
Environmental Science & Technology[IF:7.149]
① 将土壤线蚓（Enchytraeus crypticus）暴露于含不同浓度轮胎颗粒（TP）的土壤21天，评估TP的影响；② TP显著降低E.crypticus存活率，同时TP对E.crypticus繁殖率的抑制作用随浓度增加而加强；③ E.crypticus肠道细菌多样性小于周围土壤，而真菌多样性大于周围土壤；④ TP对E.crypticus肠道和土壤中的细菌和真菌多样性无影响，但显著影响其组成；⑤ E.crypticus存活率和繁殖率与肠道菌群结构相关；⑥ E.crypticus肠道中细菌和真菌群落存在协同变化。
Dysbiosis in the Gut Microbiota of Soil Fauna Explains the Toxicity of Tire Tread Particles
05-28, doi: 10.1021/acs.est.0c00917
【主编评语】塑料已经成为现代社会不可或缺的产品而被广泛应用，塑料污染也成了一个全球性的环境污染问题。作为一种特殊的塑料，从汽车和飞机轮胎中释放出来的胎面颗粒（Tread particles，TP）迄今为止还没有引起足够的重视。胎面颗粒广泛分布在土壤生态系统中。因此，迫切需要评估它们对土壤生物群落的影响。中国科学院生态环境研究中心的朱永官团队发表在《Environmental Science & Technology》上的一项研究评估了TP对土壤线蚓Enchytraeus crypticus存活率、繁殖率及肠道菌群的影响，表明TP可能通过影响土壤动物及其肠道菌群来威胁陆地生态系统。（@EADGBE）
感谢本期日报的创作者：mildbreeze，爱的抉择，大月半，爱吃番茄的Mona，szx，Echo Quasimodo，楸楸，EADGBE
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