武阳丰等：食疗改善高血压！符合中国人口味的降压循证饮食来了 | 热心肠日报
今天是第2232期日报。
武阳丰团队：中国心脏健康饮食——有效降压又好吃
Circulation[IF:39.918]
① 纳入265名收缩压130~159mmHg的受试者，在7天当地常规饮食后随机分2组，继续常规饮食（对照）或采用中国心脏健康饮食（CHH，减少钠和脂肪，增加钾、蛋白、碳水和纤维），持续28天；② 相较于基线，对照组的收缩压和舒张压降低5.0和2.8mmHg，CHH组比对照组进一步降低了10.0和3.8mmHg，4个不同菜系的CHH饮食的降压效果无显著差异；③ CHH饮食的口味评价和安全性都很好，且成本低廉（每降低1mmHg收缩压，CHH饮食的成本增加0.4元人民币/天）。
Effects of Cuisine-Based Chinese Heart-Healthy Diet in Lowering Blood Pressure Among Adults in China: Multicenter, Single-Blind, Randomized, Parallel Controlled Feeding Trial
07-11, doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.122.059045
【主编评语】地中海饮食等符合西餐饮食习惯的健康饮食模式已有大量循证数据积累，然而这类饮食模式对于很多中国人来说都是吃不惯的。研究并推广符合中餐饮食习惯的循证健康饮食模式，对于改善我国人民的健康具有重要意义。北京大学武阳丰团队在Circulation发表最新研究，首次报道了基于传统中餐设计的心脏健康饮食。这种饮食的特点包括：钠摄入量减半，增加钾摄入量，并适量减少脂肪、增加蛋白质和碳水化合物，同时膳食纤维摄入量加倍。研究者通过一项多中心单盲随机对照喂养试验，证实这种中国心脏健康饮食不仅能有效降血压（可使血压降低~10%），还保持了不同菜系中餐的美味可口，并且成本负担不大。（@mildbreeze）
50万人数据：吃饭时额外加盐，增加早死风险
European Heart Journal[IF:35.855]
① 纳入英国生物库50万余人，中位随访9.0年，分析基线时的食物加盐频率（不包括烹饪中使用的盐）与早死风险的关系；② 食物加盐频率与尿钠浓度和24小时钠排泄量正相关；③ 早死风险随食物加盐频率的增加而升高，与从不/很少加盐相比，总是加盐的人早死风险升高28%；④ 水果蔬菜摄入量可影响食物加盐频率与早死风险的关联，这种关联在果蔬摄入少的人中更明显；⑤ 与从不/很少加盐相比，总是加盐的女性和男性50岁时预期寿命分别降低1.50和2.28年。
Adding salt to foods and hazard of premature mortality
07-10, doi: 10.1093/eurheartj/ehac208
【主编评语】European Heart Journal近期表研究，基于50万人随访9年的数据，表明在餐桌上向食物中额外加盐的频率增加，与早死风险升高和预期寿命缩短有关。（@mildbreeze）
哈尔滨医科大学：AKK菌通过调控TMAO预防寒冷相关房颤
EBioMedicine[IF:11.205]
① 寒冷暴露可以增加小鼠心房颤动（AF）的敏感性，降低AKK菌丰度，且口服AKK菌可以缓解寒冷暴露诱导的pro-AF表现；② 寒冷暴露破坏AKK菌，通过影响TMA相关微生物酶增加氧化三甲胺（TMAO）水平；③ 升高的TMAO增强了M1巨噬细胞在心房的浸润，增加Casp1-p20和cleaved-GSDMD的表达，最终引发心房结构重排；④ 敲除小鼠caspase1后，其表现出对寒冷相关AF的抵抗；⑤ 横断面临床研究发现，降低AKK菌丰度是人体寒冷相关AF的一个独立风险因素。
Akkermansia muciniphila prevents cold-related atrial fibrillation in rats by modulation of TMAO induced cardiac pyroptosis
07-04, doi: 10.1016/j.ebiom.2022.104087
【主编评语】哈尔滨医科大学李悦和公永太团队研究成果。寒冷暴露是心房颤动（AF）的最重要风险因素。本研究利用16S rRNA测序、菌群移植和电生理检查，探究肠道菌群紊乱与寒冷相关AF的相关性。研究结果显示，肠道菌群紊乱是寒冷相关AF的一个新诱因，特定菌群和菌群代谢物或是其新的干预靶点。（@Bingbing）
重庆医科大学：肠道菌群参与抑郁症的潜在新机制
Journal of Advanced Research[IF:12.822]
① 共13个菌属与抑郁行为（DLB）显著相关，其中7个属于厚壁菌门；② 小鼠粪便中脂质代谢的差异主要属于甘油磷脂（GP）和脂肪酸（FA）的代谢，且有3个“代谢物类型-细菌类群”相关对：FA/GP-厚壁菌门、FA/GP-阿克曼氏菌、FA/GP-双歧杆菌；③ 与DLB相关的最关键显著差异脂代谢是GP和FA的代谢，DLB相关基因也在GP/FA代谢中富集，且SCFAs与差异菌显著相关；④ 血浆和海马体的差异脂代谢主要是GP代谢，并且海马体样本色氨酸途径中共有4种神经递质。
Multi-omics data reveals the disturbance of glycerophospholipid metabolism caused by disordered gut microbiota in depressed mice
2021-10-13, doi: 10.1016/j.jare.2021.10.002
【主编评语】重庆医科大学陈建军团队研究成果。随着研究的深入，肠-脑轴越来越被大家深入认识。本文聚焦肠道菌群与抑郁相关行为（DLB）的相关性。研究结果显示，肠道菌群可能通过影响外周/中枢的甘油磷脂（GP）代谢导致DLB，厚壁菌门-短链脂肪酸（SCFAs）-GP代谢-色氨酸途径是潜在机制。（@Bingbing）
通用型大肠癌微生物和代谢标志物
Microbiology spectrum[IF:9.043]
① 多种方法对来自不同地区CRC微生物群数据进行meta分析确定了一组CRC的全球生物标记物，并确定一种新的生物标记物a.onderdonkii；② 共发生网络分析显示CRC中的整体微生物联系减少，并存在口腔致病微生物群；③ CRC中氨基酸、尸胺和肌酸出现富集，与CRC相关微生物如Bacteroides fragilis呈正相关，与对照相关微生物如Faecalibacterium prausnitzii呈负相关④ 而丁酸、烟酰胺、胆碱、色氨酸和2-羟基丁酸与对照相关微生物呈正相关。
Meta-Analysis of Altered Gut Microbiota Reveals Microbial and Metabolic Biomarkers for Colorectal Cancer
06-29, doi: 10.1128/spectrum.00013-22
【主编评语】Microbiology spectrum近期发表的文章，通过对不同地区的结直肠癌（CRC）患者的宏基因组数据库进行荟萃分析，鉴定出一组CRC生物标志物，在不同地区都通用；同时报道了与大肠癌相关的显著差异代谢物和微生物代谢物相互作用。（@章台柳）
StrainXpress：一种针对宏基因组数据快速准确的组装方法
Nucleic Acids Research[IF:19.16]
① 微生物同种不同株间的细微差异为从宏基因组数据中组装恢复基因组带来了挑战；② StrainXpress是一种基于OLC（overlap-layout-consensus）算法的从头组装方法，采取分而治之策略，针对NGS数据可以在菌株分辨率下组装出单个基因组；③ StrainXpress能从包含上千菌株的宏基因组数据中重建菌株的基因组，也能有效应对低覆盖度的菌株；④ 在模拟和真实数据集中，StrainXpress重建菌株特异性序列的数量平均超过当前最先进方法的26.75%。
StrainXpress: strain aware metagenome assembly from short reads
07-01, doi: 10.1093/nar/gkac543
【主编评语】随着下一代测序技术的发展以及测序成本的降低，多种组装方法已经被开发在物种水平上识别和重建基因组。然而，它们在菌株水平上区分基因组的能力仍有很大的改进空间。近日，研究人员在Nucleic Acids Research发表最新研究，他们开发了StrainXpress工具，基于OLC（overlap-layout-consensus）算法从头组装，可以快速准确地从宏基因组数据中组装出单个基因组，通过模拟和真实数据也证明StrainXpress工具重建菌株特异性序列的数量优于当前最先进的方法，值得相关人员关注和测试。（@九卿臣）
香港城市大学：PhaMer可从宏基因组数据中准确识别噬菌体
Briefings in Bioinformatics[IF:13.994]
① 高多样性/丰度、参考基因组有限等因素制约着从宏基因组数据中准确和全面地检测噬菌体，现有基于比对或学习的工具普遍存在召回率和精确度无法兼顾的问题；② PhaMer采用可自主学习蛋白质组成和关联的语言模型Transformer来鉴定噬菌体；③ 基于模拟和真实数据评测，PhaMer的准确度优于其它5个主流噬菌体鉴定工具（Seeker、DeepVirfinder、VirFinder、PPR-meta、VirSorter）；④ 在真实数据中，PhaMer可将噬菌体检测的F1-score提高27%。
Accurate identification of bacteriophages from metagenomic data using Transformer
06-30, doi: 10.1093/bib/bbac258
【主编评语】近年来，宏基因组测序技术已经成为一种新的噬菌体识别手段，它可以对来自各种微生物群的所有遗传物质进行测序，基于序列比对或机器学习的噬菌体识别工具也被相继开发。近日，香港城市大学孙燕妮及团队在Briefings in Bioinformatics发表最新研究，基于语言模型Transformer开发了PhaMer（https://github.com/KennthShang/PhaMer）工具，通过模拟和真实数据评测，发现PhaMer的准确度优于目前的主流噬菌体鉴定工具，值得相关人员关注和测评。（@九卿臣）
国内团队：土源细菌或能赋予茶籽象更强的茶皂素抵抗能力
Microbiome[IF:16.837]
① 与水果相比，土壤微生物群是油茶害虫茶籽象肠道菌群的主要来源，其中不动杆菌属丰度较高；② 不动杆菌中茶皂素（油茶的一种防御性次级代谢物）降解相关代谢通路显著富集，体外实验确认不动杆菌具有降解茶皂素能力；③ 荧光标记实验证明，不动杆菌AS23菌株可以从土壤迁移到油茶象幼虫肠道中，赋予其降解茶皂素的能力，使其耐受油茶种子中的茶皂素从而能够在油茶种子中生存；④ 土壤来源的肠道菌群赋予了茶籽象更强的植物毒素耐受能力。
Soil-derived bacteria endow Camellia weevil with more ability to resist plant chemical defense
06-25, doi: 10.1186/s40168-022-01290-3
【主编评语】油茶是我国特有的木本油料作物，茶油色清味香、营养丰富、耐贮藏，是优质食用油，也可作为润滑油、防锈油用于工业。然而，茶籽象及炭疽病的爆发，是油茶低产的重要原因。近日，浙江农林大学周旭东、中国林业科学院舒金平及团队在Microbiome发表最新研究，发现茶籽象的肠道菌群受土壤的微生物群的影响要大于水果微生物群。土壤中不动杆菌属丰度较高，可在茶籽象肠道中发挥皂苷降解功能，并且通过荧光标记实验证明了土壤来源的不动杆菌AS23赋予了茶籽象更强的茶皂素抵抗能力。总之，该研究为未来解决油茶病虫害的防治问题具有重要指导意义。（@九卿臣）
韦中+周新刚：国内团队揭示生物炭抑制作物土传病害机理
iMeta[IF:N/A]
① 盆栽实验发现生物炭降低了番茄枯萎病害；② 根际菌群移植实验表明生物炭提高了番茄根际菌群对枯萎病的抑制能力；③ 16S rRNA基因高通量测序以及体外培养实验进一步揭示了番茄根际所招募的抑病型根际菌群与植物有益微生物(如假单胞菌)的增加有关；④ 生物炭增强了番茄根系分泌物对有益微生物的吸引性和促进生物膜形成的能力；⑤ 生物炭能促进番茄有效地招募抑病型根际菌群来抵御枯萎病。
Biochar stimulates tomato roots to recruit a bacterial assemblage contributing to disease resistance against Fusarium wilt
06-23, doi: 10.1002/imt2.37
【主编评语】南京农业大学韦中和东北农业大学周新刚与团队，近期在iMeta发表研究，探究了生物炭是否能促进植物招募有益细菌到根际，从而形成抑病型根际菌群。本研究表明，生物炭增强了番茄根际菌群的抑病能力，能促进番茄有效地招募抑病型根际菌群来抵御枯萎病。本研究结果让人们认识到通过农业措施增强对根际有益菌群的招募会有助于抑制土传病害，并可提高农业可持续性。（@刘永鑫-中科院-宏基因组）
感谢本期日报的创作者：mildbreeze，Bingbing，WK红叶，Akkk，往、昔℡，芥末，刘永鑫-中科院-宏基因组
0702 | Science重磅综述：靶向肠道生理，调控菌群稳态
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